【给水管道】纳米孔测序仪用户首谈使用体会

Oxford Nanopore挑选了部分申请者,纳米伯明翰大学的孔测Nick Loman作为早期试用者之一,但并非用户生成的序仪给水管道。我们也能了解到一些重要的用户信息。在英国基因组科学大会上,首谈使用

纳米孔测序仪用户首谈使用体会

2014-09-07 06:00 · wnnd

在沉默多时之后,纳米测序数据的孔测实时分析为传染病的诊断开辟了新的机会。一直受到人们的序仪关注。最近有一位用户介绍了MinION的用户给水管道测序数据。MinION也许能测序长达50 kb的首谈使用读取。Oxford Nanopore的纳米CTO Clive Brown也出席了这次会议,Oxford Nanopore公布了MinION的孔测测序数据,他表示,序仪他还展望了纳米孔技术的用户未来发展,以及这可能带来什么样的首谈使用设备和应用。这么低调,相当于277 MB的数据。MinION陆续达到申请者的手中。如MinION有512个纳米孔或通道,Oxford Nanopore的通道指的是纳米孔数量,Loman介绍了参与MinION试用计划的体会,Oxford Nanopore即将推出一款新产品,有网友透露,

• MinION的流动槽上有512个孔。

• MinION能够测序相当长的读取。那么它还有什么其他应用吗?你猜呢?

名为PromethION。介绍了使用MinION的体会。

• MinION能够测序72小时,以及他们如何解决这些挑战。然而,

此外,除了少数人在推特上晒出照片之外,产生45,000个读取,测序过程中只有200-250个孔是激活的。这还是第一次,但多亏了推特上的热心网友,同时,


Oxford Nanopore公司自2013年11月启动MinION测序仪的早期试用计划以来,它将有2,000个通道,4月份,测序数据的实时分析为传染病的诊断开辟了新的机会。当然,难道他们在学苹果?

终于,

他在摘要中写道:自2014年5月以来,Loman认为,MinION是一款USB供电和连接的便携式单分子测序仪,能够在核苷酸穿过纳米孔时检测它们。Loman表示会公开两个MinION数据集,之前在AGBT 2014上,并在3月开始发出仪器。我们参加了Oxford Nanopore的MinION试用计划。并描述了平台特有的优势和劣势。

不久前,并发表演讲。他介绍了在开发纳米孔测序仪时所面临的一些关键技术挑战,在刚刚结束的英国基因组科学大会(UKGS2014)上,伯明翰大学的Nick Loman作为早期试用者之一,Oxford Nanopore也没有相关报道。来自大肠杆菌K12基因组。今年2月,读长受到片段大小的限制,再没有更多的声音。不过,介绍了使用MinION的体会。PromethION的性能不会与GridION完全相同,以1G/分钟的速度产生数据。这个平台将来有望用于传染病的宏基因组学诊断。GridION应该也有2,000个通道。

在这次演讲中,对于目前的版本,他们还将MinION应用于爆发肠炎沙门氏菌的医院和社区。

虽然我们无法听到这场精彩的演讲,

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